Après avoir étudié le piano au Conservatoire de Bordeaux, Anne Heijboer est admise au Royal College of Music de Londres où elle travaille avec le pianiste britannique Gordon Fergus-Thompson.

Elle rejoint ensuite l’UFR de musicologie de la Sorbonne à Paris où elle obtient sa licence puis soutient, sous la direction de Philippe Cathé, un mémoire de master sur le compositeur postmoderne Alfred Schnittke.

Dans la foulée, elle est reçue à l’agrégation de musique. Depuis, elle enseigne la musique dans des collèges d’Île-de-France.